Переустановка системы - это самый крайний, самый трудоемкий и самый тупой вариант. Бывает в двух случаях: у человека не хватает квалификации убрать вирус без этого (99% случаев), вирус начисто убил систему (1%). Самое простое (но это надо делать заранее) делать раз в месяц бэкапы образа...